随着移动支付市场的进一步发展和成熟，手机支付特别是手机钱包业务将丰富运营商的业务，提高用户的黏性，但在业务发展过程中尚存在一定的困难，需要突破以下的瓶颈：
首先，高额的SIM卡更换成本及POS机的投入成为运营商推广移动支付发展的成本负担：发展手机钱包业务，需要更换SIM卡，对运营商来说价格不菲，对
上海移动、湖南移动和
重庆移动的营销活动比较我们可以看到，目前更换一张具有RFID功能的SIM卡成本大约在100元左右。考虑到今后用户规模发展可以有效降低制卡成本降低到30元左右，则按达到NTTDOCOMO的“Osaifu-Keidai”业务的渗透率规模预计渗透率达到20%，以上海地区为例，按2009年8月份超过1400万用户数估算，则需要投入的换卡成本高达8400万，如果按照3000个刷卡点，每个刷卡点POS机终端补贴1000元，则需要投入的POS补贴成本为300万；光硬件设备的投资已接近1亿；如果加上营销宣传推广费用、平台方面的投资，则所需投入则更大。
其次，手机钱包的安全性问题，可能是影响手机支付发展的重要问题：如在用户手机丢失、手机钱包业务和银行卡相关联后等情况下如何保证账户的资金安全？如何避免带有手机钱包的SIM卡被仿制？运营商需要解决安全问题。
再次，拓展合作伙伴，吸引众多联盟商家的加盟是手机支付业务发展的关键：合作商家的加盟，合作商家不达到一定的规模，用户使用业务的便利性无法体现，手机支付的规模效应无法凸显。
另外，手机支付的政策性风险，可能会给手机支付带来一些不确定性：目前，国内针对手机支付并没有明确的规定，与该业务相关的政策文件主要有《支付清算组织管理办法(征求意见稿)》和《电子支付指引(第一号)》，政策的变更可能会对手机支付带来一些不确定性。
再次，支付账户和通信账户的分离，可能会降低对用户的吸引力，影响用户的发展：目前中移动的手机钱包业务中，支付账户和通信账户进行分离，这给用户充值带来不便，因此使得业务的吸引力大打折扣；而如果将两者进行合并，则无法解决充值过程中充值卡的折扣问题，因此如何进行支付账户和通信账户的融合也在一定程度上会影响该业务的发展。
